一、沿革：

本室業務主要以正、副首長秘書、議事、法制、醫療爭議、醫政及庶務性業務等。93年1月1日起本院組織再造，企劃室歸併於秘書室，原企劃室醫務行政、為民服務考核、績效，概算、醫療合作等企劃、研考業務合併於秘書室；研究業務暨人員移撥給臨床醫學研究部；教學業務移撥教學中心；品質管理業務暨人員歸屬品質管理中心運作；而原秘書室新聞、公關業務暨人員則移撥於公共事務室。104年法制室成立將法制業務轉至法制室，107年因應公共事務室業務調併，將其中公關新聞業務移至秘書室。

現任主任：林志豪(112.08～迄今)      

歷任主任：張    雍(77.06～86.08)

                  許夙君(86.09～92.12)

                  謝忠焚(93.01～94.09)

                  潘倩慧(95.08～97.08)

                  張少寧(97.09～100.03)

                  陳鵬升(100.03～112.08.15)        　

二、業務項目：

 1、秘書業務

 2、院務會議、醫務會議議事業務

 3、醫院評鑑業務

 4、醫學中心任務審查

 5、醫院緊急醫療能力評定

 6、醫政及衛生局督考

 7、全院知識管理

 8、醫療合作業務

 9、績效獎勵金業務

10、固定資產年度概算編列

11、法院鑑定案

12、新聞媒體公關

13、醫療爭議